يهدف قسم الفسيولوجيا الطبيه إلى تحقيق رؤيته من خلال تنفيذ الأهداف التالية:

1. تهيئة الظروف التى تعطى الفرصة للكليه وأعضاء هيئة التدريس والطلاب إلى المزيد من تطور المهارات الفنيه.

2. تقديم المعلومات الحديثه من الفسيولوجيا الطبية التى توضح للطلاب مفهوم التوازن الداخلى للجسم من خلال وظائف الأعضاء.

3. تحقيق التكامل في حقائق ومفاهيم وظائف الأعضاء لحل المشاكل الطبيه.

4. تعليم الطلاب ان الحياه تعنمد على الوظائف الكليه للجسم وليس عل وظائف أجزاء الجسم كل منها بمعزل عن الأجزاء الأخرى والفسيولوجيا الطبيه تربط كل وظائف الجسم المختلفة لتحقيق هذا الاتجاه.

5. الربط بين الأبحاث التطبيقية والمشروعات الأخرى التي تدعم مفهوم وظائف الأعضاء.

6. تطوير علم وظائف الأعضاء من خلال تخفيز الفكر الخلاق والمسقل.